近日，我司孙艳发博士以威尼斯人91111为第一单位在国际著名期刊《Genome Medicine》（IF=11.117）发表题为 “A transcriptome-wide association study of Alzheimer’s disease using prediction models of relevant tissues identifies novel candidate susceptibility genes”的研究论文，使用不同组织的基因表达预测模型，通过全转录组关联研究（TWAS）鉴定阿尔茨海默病新的候选易感基因，提高了对阿尔兹海默风险遗传学和病因学的理解。

阿尔茨海默病是老年人群中常见的神经退行性疾病。全基因组关联研究（GWAS）已经鉴定了超过56个与阿尔茨海默病关联的易感性位点，但负责这些关联的基因在很大程度上仍然未知。该研究通过改进的UTMOST方法构建了基因表达预测模型，系统评估10个脑组织和脾脏组织转录组中基因的预测基因表达量与阿尔茨海默病风险的关联。发现53个基因在脑组织中预测表达量与阿尔茨海默病风险相关，其中35个在以前的TWAS中未被报道。精细定位分析确定了53个可能导致阿尔茨海默病风险的基因中的21个。21个精细定位的基因中有10个为本研究首次报道。在脾脏组织TWAS分析中确定了特定基因的关联。这些发现有助于进一步了解阿尔茨海默病的病因学和遗传学。  

       阿尔茨海默病全转录组关联研究曼哈顿图，图片来自Genome Medicine。

 该项目部分经费由“福建省人力资源和社会保障厅2018-2019年度高层次人才和青年优秀人才访学研修资助计划”和“中央引导地方科技发展专项（2019 L3011）”资助。我司孙艳发博士、夏威夷大学Jingjing Zhu博士和范德堡大学医学中心Dan Zhou博士为共同第一作者。英国剑桥大学的Eric R. Gamazon博士和美国夏威夷大学的Lang Wu博士为共同通讯作者。

原文链接：https://genomemedicine.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13073-021-00959-y